Templul Şofu Kusi
În 1677, în Nagasaki a fost fondat complexul budist de temple Sōfukuji, care a devenit cea mai veche construcție din oraș. Acesta aparține curentului Zen și face parte din „cealaltă” tetradă a mănăstirilor budiste ale „fericirii”. Fondatorul complexului templului a fost călugărul chinez Te’yeusin Dohan - nepotul celebrului poet și călugăr Ing’en. Arhitectura întregului complex este realizată în stilul din perioada dinastiei Tang. În 1715 a fost efectuată o reconstrucție a clădirii principale a mănăstirii. Este o construcție mică, cu acoperiș dublu, de asemenea păstrată în stil chinezesc. Templului îi aparține cel mai mare clopot din oraș. Acesta este folosit doar cu ocazia Anului Nou, conform calendarului budist, a devenit celebru în toată Japonia și face parte din lista monumentelor arhitecturale.
Templul Kofuku-ji
În 1624 a fost înființat complexul de temple budiste Kofukuji. Acesta a devenit cel mai vechi mănăstire budistă construită de diaspora chineză în Nagasaki. Kofukuji aparține curentului zen, aparține școlii Ōbaku și face parte din cvartetul templelor budiste „ale fericirii” din oraș. Complexul templului a apărut ca urmare a faptului că, în 1620, comercianții chinezi i-au cerut primarului din Nagasaki să construiască pe teritoriul său un mic templu pentru rugăciuni. Ei doreau să ceară protecția zeilor în călătoriile pe mare. Aceste evenimente au avut loc într-o perioadă în care guvernul Japoniei se opunea creștinismului și susținea budismul și șintoismul. Mănăstirea Kofukuji este realizată în stilul tradițional chinezesc din perioada dinastiei Ming.
Biserica Oura
În decembrie 1864, în orașul Nagasaki a fost finalizată construcția bisericii Oura. Este un lăcaș romano-catolic, care este numit și biserica celor 26 de martiri japonezi. Edificiul îmbină stilul baroc și neogoticul și face parte din rândul comoaror naționale ale Japoniei. Construcția albă ca zăpada are un acoperiș triunghiular, deasupra căruia se ridică un turn cu cruce. În fața templului se află dealul Nisidzaka. În 1597, pe el au fost răstigniți 26 de japonezi, care urmaseră credința creștină. În amintirea creștinilor din Japonia, lângă intrare a fost ridicată o statuie albă din marmură a Maicii Domnului. În curtea bisericii a fost instalat un basorelief din bronz. Istoria lui este legată de un grup de țărani din Urakami, care și-au păstrat credința în secret, în ciuda tuturor persecuțiilor din partea autorităților.
Complexul templului Fukuzaiji
Fukusaiji - un complex de temple budiste, aparținând școlii Obaku, orientării zen și este unul dintre cele „4 mănăstiri ale fericirii” budiste din Nagasaki. Fukusaiji a fost fondat în 1628 de călugări din China. La 9 august 1945 complexul templului a fost distrus de bombardamentul atomic, dar în 1979 mănăstirea a reușit să fie reconstituită. A fost construit un nou templu în memoria celor uciși în urma bombardamentului atomic al orașului. În fiecare zi, la 11:02, în exact ora exploziei, răsună clopotul templului. Mausoleul este realizat sub forma unei țestoase uriașe cu un statuiță albă mare a unei bodhisattva pe spate. În interior, la bodhisattva Kannon este amplasat pendulul lui Foucault, cu o înălțime de 25 de metri; acesta se mișcă deasupra rămășițelor a 16 500 de victime care au murit în timpul celui de-Al Doilea Război Mondial.